Evaluer l’état biologique de sols industriels en perspective d’un aménagement du site

Objectif stage
Sur la base de différents projets de restauration et de suivi des écosystèmes dégradés (Hydrocarbures
et ETM) disponibles dans la littérature scientifique spécifiquement sur des sols industriels, ce stage a
pour but de répondre aux objectifs suivants :

  1.  A partir de prélèvement et d’analyse de sol, réaliser une cartographie des caractéristiques
    biophysicochimiques des zones à végétaliser en priorité.
  2. Evaluer, dans les conditions de stress existantes, des espèces végétales seules ou en
    association, susceptibles de stimuler les fonctions du sol (régulation flux hydrique,
    séquestration carbone, biodiversité, cycle des éléments nutritifs et renaturation).
  3. En compilant la cartographie biophysicochimique & l’approche bibliographique, proposer un
    dispositif expérimental cohérent pour les espaces à végétaliser en priorité.
  4. En parallèle, améliorer la compréhension de l’effet de stimulation de la microflore du sol en
    étudiant l’influence de certaines molécules exsudées au niveau du système racinaire des
    plantes sur les microorganismes spécifiques associés à sa rhizosphère.

Pour répondre à ces objectifs, l’étudiant bénéficiera d’un accès aux plateformes et plateaux techniques
de l’unité de recherche AGHYLE. Un des livrables de ce master sera d’inventorier les plantes candidates
en perspective de l’aménagement du site industriel en associant des traits fonctionnels des végétaux
et des indicateurs microbiologiques.

Travail demandé
• Veille bibliographique.
• Prélèvements et suivi des analyses de sol dans la zone à végétaliser en priorité (Analyses
physico-chimiques, analyse de l’état biologique (extraction quantification marqueurs
moléculaires (ADN, Ergostérol…), quantification des abondances bactériennes et fongiques,
diversité biologique (séquençage), mesure d’activités biologiques (activités enzymatiques,
fonctions de minéralisation C, N).
• Mise en place d’une expérience en pots, suivi de la culture et échantillonnage, analyse de la
végétation (réponse des traits fonctionnels impliqué dans la nutrition des plantes : production
de biomasse, exsudats racinaires, composition minérale des feuilles), analyse des
microorganismes de la rhizosphère
• Collecte, analyse statistique, valorisation et évaluation critique des données générées.

Compétences attendues
Sciences végétales, Sciences du sol, microbiologie des sols, biologie moléculaire. Une expérience en
laboratoire est fortement souhaitée.

Une attention particulière sera portée sur les candidatures d’étudiants d’écoles d’ingénieur dans les
domaines de l’agronomie, la science du sol ou les sciences de l’environnement et aux étudiants de
Master 2 Sols Eaux Environnement, Gestion de l’Environnement, Chimie et sciences du vivant, Risques
et environnement, Environnement et risques industriels et urbains, Microbiologie Environnement &
Santé, Microbiologie ou Microbiologie Industrielle et Biotechnologie.

Conditions du stage
Lieu de travail : Rouen, des déplacements sur le campus de Beauvais seront à prévoir.
Durée : 6 mois
Indemnités de stage selon la législation en vigueur
Permis B indispensable

Renseignements complémentaires et candidatures
Les candidatures (CV, lettre motivation, relevé notes M1 & M2) sont à adresser à : Fabiana Fabri
(fabiana.fabri@unilasalle.fr), Isabelle Trinsoutrot Gattin (Isabelle.GATTIN@unilasalle.fr), Stéphane
Firmin (stephane.firmin@unilasalle.fr), avant le 15/01/2023